La Marine togolaise, chargée de la surveillance littorale, a été initialement organisée selon le modèle français. Jusqu’en 1987, des équipages mixtes franco-togolais opéraient sur ses navires, et son état-major a été dirigé par des officiers français jusqu’en 1992. Bien que la formation des marins reste partiellement effectuée en France, la flotte s’est diversifiée depuis les années 2010 avec l’acquisition de vedettes et de navires en provenance des États-Unis et d’Afrique du Sud
Depuis 2022, le Chef d'État-Major de la Marine est le capitaine de frégate Atatoum Babaté